Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD23BP54727 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms