Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATP12AP54707 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATP12AP54707 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATP12AP54707 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATP12AP54707 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATP12AP54707 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP12AP54707 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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