Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THOP1P52888 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THOP1P52888 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms