Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCLMP48507 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCLMP48507 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms