Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZEB1P37275 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms