Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms