Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALDH4A1P30038 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ALDH4A1P30038 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms