Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA4P25789 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms