Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms