Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms