Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IFITM1P13164 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms