Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM200BP0CF97 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM200BP0CF97 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM200BP0CF97 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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