Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APODP05090 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APODP05090 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APODP05090 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms