Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYBBP04839 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms