Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms