Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP9YO00507 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP9YO00507 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP9YO00507 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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