Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms