Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM149AA5PLN7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms