Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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