Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTC7AQ9ULT0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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