Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms