Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RCC2Q9P258 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RCC2Q9P258 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms