Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms