Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms