Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms