Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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