Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms