Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PITX2Q99697 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PITX2Q99697 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PITX2Q99697 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PITX2Q99697 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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