Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms