Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00526Q96FQ7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00526Q96FQ7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms