Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms