Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2R2Q712K3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms