Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms