Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBAP2Q5T6F2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms