Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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AP5B1Q2VPB7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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