Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMU1Q2TAY7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms