Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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SNAPC1Q16533 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SNAPC1Q16533 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SNAPC1Q16533 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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