Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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