Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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