Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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