Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms