Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms