Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms