Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms