Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms