Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IL9RQ01113 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IL9RQ01113 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms