Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms