Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBP5P82980 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBP5P82980 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP5P82980 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP5P82980 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms