Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF3P78545 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms