Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX1P78337 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX1P78337 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms